سوف يسهم هذا البرنامج في تحقيق الهدف الإستراتيجي الثالث وهو تعزيز التكامل الزراعي العربي وتأطير آليات وإجراءات وسياسات نظم التجارة والاستثمار الزراعي العربي، وسوف يسهم في تحقيق الأهداف الفرعية التالية:

1. المحافظة على صحة الإنسان والنبات والحيوان بدعم أطر وآليات مكافحة الآفات والأمراض المشتركة والعابرة والمستوطنة.
2. رفع القدرة التنافسية للمنتجات الزراعية العربية بدعم تحقيق أطر وآليات سلامة الغذاء.

وكذلك يهدف إلى تحقيق أهداف التنمية المستدامة التالية:

الهدف 2: القضاء على الجوع وتوفير الأمن الغذائي والتغذية المحسّنة وتعزيز الزراعة المستدامة.

الهدف12: ضمان وجود أنماط استهلاك وإنتاج مستدامة.

ويشتمل على ثلاثة برامج فرعية كما يلي:

1. البرنامج الفرعي للآفات والأمراض الحيوانية.

2. البرنامج الفرعي للآفات والأمراض النباتية.

3. البرنامج الفرعي لسلامة الغذاء.